Nachdem der Reaktor erst am 19.06.2009 wieder angefahren wurde, gab es bereits am 23.06.2009 eine erste Panne. Eine elektronische Baugruppe zum zeitverzögerten Auslösen einer Reaktorschutzmaßnahme war ausgefallen.

Am 01.07.2009 wurde der Reaktor ganz vom Netz genommen, da sich eine Turbine wegen dem Ausfall eines "Eigenbedarfstransformators" abgeschaltet hat.

Mehrere Umweltverbände und die Grünen fordern die endgültige Abschaltung von Krümmel. "Die Sicherheit der Bevölkerung hat Vorrang vor den Profitinteressen eines Energiekonzerns." so der Grünen-Bundestagskandidat Konstantin von Notz.